Su carrera profesional comenzó en el ámbito de la ingeniería civil, en la compañía Técnicas Reunidas, S.A. Posteriormente ingresó en Volvo Concesionarios, donde desarrolló gran parte de su carrera profesional en distintas funciones en las áreas de posventa y comercial. En diciembre de 2001 se incorporó a DAF en la dirección de Desarrollo de Concesionarios.
Fernando Ruipérez es ingeniero técnico aeronáutico por la Universidad Politécnica de Madrid; además es diplomado en Administración y Dirección de Empresas por la misma Universidad.
